Программное обеспечение

1. Пакет управления работой сканера.

Для каждого микро и нанотомографа имеется своя управляющая программа, учитывающая все особенности работы с данным прибором и  позволяющая быстро настроить системы под конкретный объект исследования. Весь функционал подробно разобран в  практическом руководстве к каждому типу сканера и регулярно пополняется новыми опциями.

2. Программный пакет для трехмерной реконструкции (NRecon):

• многопоточная реконструкция на многоядерных CPU.
• гибридная CPU/GPU реконструкция,
• реконструкция на GPU кластере,
• InstaRecon иерархическая реконструкция.

Стандартная реконструкция методом обратного проецирования:

NxN пикселов, N угловых проекций => N x N x N = N³ операций.

Иерархическая реконструкция InstaRecon:  N x N x log₂N операций.

Реконструкция ведется с автоматической  подстройкой под геометрию сканирования каждого конкретного прибора.

Реконструированные сечения могут быть сохранены в формате BMP, TIFF, JPG или числовом формате. NRecon постоянно отслеживает производительность компьютеров и скорость передачи данных по сети для оптимизации распределения вычислений. Программа предусматривает коррекцию изменения спектра рентгеновского излучения при прохождении через объект, компенсацию кольцевых искажений, возможность реконструкции выделенной области и объектов превышающих поле сканирования, внешнюю и внутреннюю калибровку по шкале Хаунсфилда и выбор границ отображаемых плотностей. NRe­con позволяет использовать изображения проекций большого размера для реконструкции виртуальных сечений размером до 8000х8000 пикселей. Пакетная обработка данных обеспечивает расчет задач с разными параметрами без участия оператора.

3. Программа  визуализации реконструированных изображений в ортогональных сечениях с сохранением оригинального объема и разрешения (Data Viewer)

Программа Data Viewer предназначена для просмотра реконструированных сечений. Изображения могут выводиться послойно или в виде трех ортогональных сечений пересекающихся в любой точке образца. Сечения можно перемещать и вращать в любом направлении с помощью мыши. Дополнительно возможно отображение четырехмерных данных полученных при разрешении по времени  испытаний на сжатие-растяжение. Программа поддерживает различные виды сглаживания, сохранение продольных или поперечных сечений, измерения расстояний между точками в трехмерном пространстве и профилей интенсивности. Конвертер форматов T-conv преобразует форматы BMP, TIFF и JPG с корректировкой цветовых схем, инверсией цветов, изменением размеров изображений и т.д. Специальная программа DicomCon­verter позволяет преобразовать результаты реконструкции в формат DICOM 3.

4. Программа  проведения точного детального анализа морфологических и плотностных характеристик (CTan).

CT-an позволяет проводить морфометрию и денситометрию исследованных объектов, выделение сегментов и их увеличение, а также измерения характеристик от величин пористости, до площади поверхности частей заданной плотности и любой сложности строения.

Основные возможности и анализируемые параметры:

• импорт и экспорт данных в tiff, bmp, jpg
• пространственная перекомпоновка под любым объемным углом
• свободный выбор части объекта для изучения (VOI-объем интереса, ROI-область интереса)
• измерения расстояний и углов в пространстве
• создание изображений максимальной интенсивности (MIP)
• калибровка плотности по HU, BMD или коэффициенту поглощения
• сглаживание, удаление шумов, морфологические преобразования
• программирование порядка выполняемых функций (постановка сценария)
• анализ структур внутри VOI в 2D, 3D
• анализ всех объектов внутри ROI/VOI в 2D, 3D
• параметры измерений: объем объекта (поры, частицы и т.д.)
• площадь поверхности,
• индекс модельной структуры (SMI),
• трабекулярный коэффициент (TB.Pf), трабекулярная толщина (распределение и средние значения) (Tb.Th), трабекулярное число (Tb.N),
• степень анизотропии, стереологические параметры, числа Эйлера (EN), фрактальная размерность по Холмогорову
• момент инерции (MOI), эксцентриситет
• подробный анализ пористости
• возможность работы в пакетном режиме анализа
• калибровка измерений по эталонным образцам
• создание 3D моделей по нескольким алгоритмам

5. Программа  рендеринга поверхностей(CTvol).

CTvol обеспечивает просмотр, интуитивную навигацию и удобное управление текстурами и прозрачностью 3D моделей, возможность создания видеороликов.
CTvol отображает модели реконструированных объектов, полученные в CTan, включая модели в формате STL.

Основные возможности:

• выбор фона с возможностью использования произвольных сцен;
• перемещение, вращение, масштабирование одной или нескольких моделей, вместе и по раздельности;
• управление текстурой, цветом, освещением и прозрачностью объектов;
• возможность реализации «вида изнутри» отрезая части модели или делая ее прозрачной;
• быстрое и легкое создание видеороликов для анимированных презентаций сканированных объектов заданием нескольких ключевых положений с последующей автоматической интерполяцией.

6. Программа  объемного рендеринга(CTvox) c экспортом данных для мобильных приложений.

CTvox–программное обеспечение для объемной визуализации, основанное на технике объемного рендеринга отображает набор реконструированных срезов в трехмерные изображения с интуитивно понятной навигацией.

Основные возможности:

•  подсветки выбранных областей
•  получение любой сложности разрезов внутри объекта
• задание любого фона, освещения, тени
• функция «прохождения насквозь» и кругового просмотра
•  создание анимационного ролика по выбранным кадрам положения объекта
• стериоизображение
• экспорт данных для мобильных приложений

7. Программы  объемного рендеринга для мобильных устройств, работающих под iOS и Android.

Для мобильных устройств, работающих на платформ iOS и Android, разработаны приложения для объемного рендеринга, которые можно найти в Apple-Store и Google Play соответственно.